Лучше всего сохраняется мотыль в домашнем холодильнике, где его можно держать продолжительное время.
Мотыль, завернутый, но очень свободно, в шерстяную тряпочку темного цвета, кладут в деревянный коробок, сделанный из дуба или из другого дерева крепкой породы. В крышке коробки сверлят несколько мелких отверстий для вентиляции воздуха. Коробок помещают в холодильник, там, где температура воздуха равна нулю или 1°C тепла. При температуре ниже нуля мотыль в живом виде не сохраняется.
Шерстяную тряпочку надо раз в сутки прополаскивать в холодной воде, так как в грязной тряпочке мотыль быстро гибнет. Когда ее промывают, мотыль осторожно высыпают на сухой лист бумаги и перебирают, удаляя погибших.
Некоторые рыболовы предлагают хранить мотыля в ведре с водой, которую меняют два раза в сутки; другие - в марлевом мешочке или в маленьком ящике из мелкой металлической сетки, опуская в смывной бачок, аргументируя длительность хранения частой сменой воды. Но они упускают из виду, что водопроводная вода очищается не только фильтрами, но известково-содовым способом - воздействием на воду химическими реактивами и способом стерилизации - хлорирования, при котором вводят иногда до 1 г активного хлора на 1 кубический метр воды. Следовательно, хранение мотыля в воде, содержащей хлор в дозах, безвредных для человека, но вредных для мотыля, рекомендовать нельзя, так как часть его неизбежно погибнет.
Однако если мотыля погружать в воду не только что налитую в ведро из водопровода, а предварительно отстоявшуюся хотя бы в течение 6-7 часов, он будет сохраняться дольше. Для такого хранения мотыля необходимо иметь всегда два ведра. Пока мотыль будет находиться в одном ведре, в другом будет отстаиваться вода, и за это время из нее в какой-то степени улетучится хлор. Смену воды можно делать 1-2 раза в сутки.